Tốt nghiệp Đại học Y Dược TP HCM - nơi được xem cái nôi đào tạo nhiều bác sĩ giỏi, là nguồn cung ứng bác sĩ đáng tin cậy cho các bệnh viện trong khu vực. BS.CKI Huỳnh Văn Trung được may mắn học tập, làm việc và trưởng thành trong môi trường chuyên nghiệp. Với nỗ lực trở thành một bác sĩ giỏi, bác sĩ Huỳnh Văn Trung không ngừng trau dồi trình độ chuyên môn nghiệp vụ trong chẩn đoán và điều trị bệnh lý tiêu hóa.
Từ năm 2004 - 2010: Bác sĩ đa khoa Đại học Y dược TP HCM
Từ năm 2013 - 2015: Bác sĩ chuyên khoa 1 nội tổng quát Đại học Y dược TP HCM
Từ tháng 9/2016 - 12/2016: Đào tạo liên tục chuyên ngành Tiêu hóa - Gan mật, Bệnh viện Chợ Rẫy
Từ năm 2010 - tháng 7/2016: Bệnh viện đa khoa khu vực Củ Chi.
Từ tháng 7/2016 - 2020: Bệnh viện Hoàn Mỹ Sài Gòn.
Hiện nay: Bác sĩ Nội Tiêu hóa - Gan mật, Trung tâm Nội soi & Phẫu thuật Nội soi Tiêu hóa, Bệnh viện Đa khoa Tâm Anh TP HCM.